Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms