Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CEP295Q9C0D2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP295Q9C0D2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms