Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHACTR1Q9C0D0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms