Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms