Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCGF6Q9BYE7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms