Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms