Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
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