Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRIP1Q9BX63 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms