Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC11Q9BVV2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms