Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP250Q9BV73 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP250Q9BV73 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms