Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms