Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms