Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NSMCE2Q96MF7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NSMCE2Q96MF7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms