Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC74BQ96LY2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms