Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms