Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG3Q96JB2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms