Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIRT1Q96EB6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms