Protein–RNA interactions for Protein: Q96E35

ZMYND19, Zinc finger MYND domain-containing protein 19, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND19Q96E35 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZMYND19Q96E35 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZMYND19Q96E35 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms