Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC11Q96DB2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms