Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC1Q96C34 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms