Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms