Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms