Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms