Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms