Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms