Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms