Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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