Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms