Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP1Q8N7R0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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