Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GCSAMQ8N6F7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GCSAMQ8N6F7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms