Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms