Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS3Q8IXF0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms