Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF554Q86TJ5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms