Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms