Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF550Q7Z398 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms