Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS1

BHLHA15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA15Q7RTS1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA15Q7RTS1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA15Q7RTS1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms