Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms