Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD6Q6ZV73 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD6Q6ZV73 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms