Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTE2Q6XPS3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms