Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms