Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms