Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms