Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms