Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCD3Q6STE5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCD3Q6STE5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms