Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms