Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOGA3Q5TF21 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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