Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms