Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms