Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms