Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC153Q494R4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC153Q494R4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms